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一种基于角度特征的短时序基因表达数据聚类方法

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专利号 2020100604295 专利名称 一种基于角度特征的短时序基因表达数据聚类方法
专利类型 发明专利 国际分类 G16B30/00(2019.01),G16B40/00(2019.01),G06F18/23(2023.01)
申请人 西安理工大学 申请地址 710048 陕西省西安市金花南路5号
发明人 李爱民 申请日期 2020-01-19
下证状态 已下证 更新时间 2026-09-17 17:22:59
专利摘要 一种基于角度特征的短时序基因表达数据聚类方法,包括以下步骤:步骤1,计算角度特征;步骤2,用Affinity Propagation聚类算法聚类;步骤3,获得功能显著的类;把基因表达变化趋势相似的基因聚为一类,同属于一类的基因有功能相似的趋势;对于每一个基因,相邻时间点的基因表达的变化可以计算出角度特征,反映基因表达的局部变化趋势;对于每个时间点,用换算后的角度间接反映整体的表达水平情况;以这些角度为特征,皮尔森相关系数作为相似性测度,相关系数越大,表示两个基因的表达谱越相似;然后用Affinity Propagation聚类算法聚类;具有聚类结果更能反映基因功能、聚类结果做功能富集分析的p值更小的特点。

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企业组织机构代码证
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卖方 企业营业执照
专利证书原件
身份证
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