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高阶SNP致病组合数据检测方法、系统、计算机设备

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专利号 2020111212911 专利名称 高阶SNP致病组合数据检测方法、系统、计算机设备
专利类型 发明专利 国际分类 G16B40/00(20190101),G16B20/30(20190101)
申请人 西安邮电大学 申请地址 陕西省西安市雁塔区长安南路563号西安邮电大学
发明人 拓守恒 申请日期 2020-10-19
下证状态 已下证 更新时间 2026-09-17 17:22:59
专利摘要 本发明属于致病SNP组合数据检测技术领域,公开了一种高阶SNP致病组合数据检测方法、系统、计算机设备,利用Plink从VCF文件中读取出PED,MAP格式数据,整理成SNP样本矩阵;根据数据中SNP位点和样本量的大小,设置搜索算法参数;将SNP样本数据读入,进行高阶SNP致病组合位点筛选,将和声搜索策略的全局搜索能力与差分演化算法的快速计算能力进行融合;进行迭代搜索;迭代过程结束后,合并4个独立种群中的个体;采用改进的G‑test统计检验方法进行样本的差异显著性检验;通过G‑test检验的SNP组合被认为是可能的高阶SNP致病组合。本发明有效地降低了对致病模型的偏好性。

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卖方 企业营业执照
专利证书原件
身份证
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