发明专利
专利类型未知
专利状态2022104232657
专利号专利号 | 2022104232657 | 专利名称 | 评估基因组组装完整度方法及装置 |
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专利类型 | 发明专利 | 国际分类 | G16B30/20(2019.01),G16B35/00(2019.01) |
申请人 | 内江师范学院 | 申请地址 | 641100 四川省内江市东兴区东桐路内江师范学院 |
发明人 | 吕云云 | 申请日期 | 2022-04-21 |
下证状态 | 未知 | 更新时间 | 2025-01-11 08:52:26 |
专利摘要 | 本发明公开了一种评估基因组组装完整度方法及装置,根据测序报告确定测序reads的长度和测序错误率;在基因组序列中的随机位置上产生模拟reads;根据测序错误率在模拟产生的reads上进行错误性碱基替换;对实际和模拟产生的reads逐个碱基进行一定长度短片段kmer的抽取,并比较其反向互补配对序列,取在字母表排列在前的kmer作为序列标识;根据不同标识kmer的出现频次分布,计算所有kmer的频次深度分布;根据模拟测序数据产生的kmer频次深度分布与实际测序数据产生的kmer频次深度分布来评估基因组组装完整度。本发明整体设计不依赖于其他数据库,采用简单可行的手段对基因组进行科学合理的完整性评估。 |
买卖双方需提供 | 平台提供 | 转让后买方可获得 | ||
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企业 | 个人 | 专利代理委托书 专利权转让协议 办理文件副本请求书 发明人变更声明 | 专利证书 手续合格通知书 专利登记簿副本 | |
买方 | 企业营业执照 企业组织机构代码证 | 身份证 | ||
卖方 | 企业营业执照 专利证书原件 | 身份证 专利证书原件 |
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