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基于混合蛙跳算法识别关键蛋白质的方法

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专利号 2018116434615 专利名称 基于混合蛙跳算法识别关键蛋白质的方法
专利类型 发明专利 国际分类 G16B20/00,G16B40/00
申请人 申请地址 陕西省西安市长安区西长安街620号
发明人 申请日期 2018-12-29
下证状态 未知 更新时间 2025-01-10 08:35:18
专利摘要 本发明公开了一种基于混合蛙跳算法识别关键蛋白质的方法,通过将蛋白质相互作用网络转化为无向图、获取蛋白质对应的亚细胞定位信息、蛋白质复合物参与信息以及功能注释信息、对蛋白质相互作用网络中结点和边进行处理、根据蛋白质结点的局部平均连通性初始化青蛙种群、根据青蛙的适应值划分族群、青蛙在族群中进行元进化,执行局部搜索、所有青蛙进行全局思想交流,执行全局搜索、产生关键蛋白质。本发明方法能准确地识别关键蛋白质;仿真实验结果表明,灵敏度、特异性、F测度、阳性预测值、阴性预测值以及正确率等指标较优;与其他关键蛋白质识别方法相比,将混合蛙跳算法的优化特性与蛋白质相互作用网络的拓扑特征以及蛋白质自身的生物特性进行结合来识别关键蛋白质,提高了关键蛋白质的识别准确率。

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