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一种基于深度学习的双神经网络结构预测lncRNA-蛋白质相互作用方法

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专利号 2021105924434 专利名称 一种基于深度学习的双神经网络结构预测lncRNA-蛋白质相互作用方法
专利类型 发明专利 国际分类 G06K9/62(2006.01),G06N3/04(2006.01),G06N3/08(2006.01),G16B5/00(2019.01),G16B40/00(2019.01)
申请人 申请地址 412000湖南省株洲市天元区泰山路88号
发明人 申请日期 2021-05-28
下证状态 未知 更新时间 2025-01-10 08:12:14
专利摘要 本发明涉及一种基于深度学习的双神经网络结构预测lncRNA-蛋白质相互作用方法。首先,LPI特征提取:先获取已知的lncRNA序列、蛋白质序列,分别用Pyfeat和BioTriangle提取lncRNA和蛋白质的特征;然后,特征降维:基于主成分分析(PCA)分别对lncRNA和蛋白质原始特征进行降维,在降维之后将这些特征连接成一个向量;其次,建立LPI预测框架模型:建立由FIR网络和MLP网络组成的双神经网络结构的深度学习模型;最后,利用双神经网络结构对未知lncRNA‑蛋白质对进行分类。本发明比利用实验手段探测大规模的lncRNA‑蛋白质交互作用耗时更少,费用更低,可以实现对多个数据集进行训练和测试,预测偏差小,预测性能好,预测结果准确,并可以用于寻找新的lncRNA‑蛋白质关联对。

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卖方 企业营业执照
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身份证
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